QIWI - 5
Плюсы:
1) Быстрая и легкая регистрация
2) Работает через веб-интерфейс и потому нет привязки к определенной ОС.
3) Интуитивно понятный интерфейс на русском языке.
4) Удобство пополнения счёта мгновенно и без коммисии (разные варианты).
5) Хороший выбор для вывода средств. Например на пластиковую карту (быстрее приходит на карты VISA) или перевод в другую платёжную систему.
6) Даже при активном и длительном пользовании платежной системой не возникает проблем с которыми нужно обращаться в техническую поддержку!
7) КИВИ считается интернет магазином и потому есть РЕДКАЯ возможность ОБНАЛИЧИВАНИЯ кредитных карт с МИНИМАЛЬНЫМИ потерями (2% + 20 рублей)!
8) Безопасность системы на хорошем уровне, в частности подтверждение операций кодом по СМС.
9) Оплата многих услуг, например: пополнение баланса провайдера, пополнение баланса на телефоне и т.д.
10) Услуги можно оплачивать как в терминале так и через онлайн кабинет.
11) По желанию клиента могут выпустить пластиковую карту. Также в их сервисе есть возможность завести виртуальную пластиковую карту, что очень удобно для интернет покупок, когда не хочется светить реальный CVC код карты (дополнительный плюс к безопасности).
Минусы:
1) Привязка кошелька к конкретному номеру телефона
2) Ограничение на переводимую сумму в 15 тысяч рублей за одну операцию.
3) Не выгодны переводы в другие платёжные системы.
4) Регистрация аккуанта на Российские номера телефонов.

WebMoney - 1
Плюсы:
1) Очень популярна среди не продвинутых пользователей платежных систем (более 90% всех держателей кошельков.
2) Есть обменные пункты в крупных городах, в которых возможен ввод/вывод достаточно крупных сумм (миллионы рублей).
3) Можно включать код протекции для получения сумму - иногда это полезно. Однако не каждый находит эту возможность (см. минусы пукнт 2).
Минусы:
1) Признают её только в России и на Украине.
2) Отвратительный интерфейс. Что генерирует множество проблем и вопросов. В частности многие пользователи заводят по несколько кошельков из-за всякого рода возникающих проблем (см. минусы пукт 10) или с целью мошеннических манипуляций (см. минусы пункт 6).
3) Почти не реально найти возможность свзяи с техподдержкой. А когда удаётся, то футболят по другому адресу. Проблемы техподдержка решать не любит. Часто, время на решение вопроса уходит столько, что было бы проще и менее затратно выполнить финансовую операцию в другой системе. Каждый раз решая очередную проблему попадаются их представители-посредники которые занимаются предоставлением платной услуги по получение сертификатов разных уровней для держателя кошелька. Такие представители не двухсмысленно намекают на дополнительную трату для получения сертификата более высокго уровня. По факту, повышение сертификата не улучшает качество сервиса.
4) Заурядному пользователю не легко разобраться с системой.
5) Больший упор делают на программу-клиент Keeper под ОС Windows, что очень сильно ограничивает пользователей других ОС.
6) Очень развито мошенничество (кредиты, воровство кошельков и т.д.). По факту есть только одна реальная защита это использование Keeper с настроенным enum на все операции. Все остальные способы защиты не эффективны, но понимают это единицы (см. плюсы пункт 1). В случае мошенничества от техподдержки помощи можно не ждать - помощи не будет, а если будет, то как мертвому припарка.
7) Высокий уровень BL (бизнес уровень) по факту совсем не является показателем надежности и повышенного уровня доверия держателя такого кошелька, т.к. на "чёрном рынке" можно недорого купить кошелёк с нужным BL.
8) Продвинутые страны и крупные финансовые учреджения предпочитают не связываться с WebMoney.
9) Случаются «репрессии» связанные с WebMoney(см. ситуацию на Украние с кошельками WebMoney, когда отнимали кошельки и устраивали допросы).
10) Система WebMoney может кинуть держателя кошелька в любой момент. Самое простое это блокировка счёта, а так ещё могут сослаться на пункт в оферте что в праве любому отказать в обслуживани без пояснения причин.

Яндекс-деньги — 4
Плюсы:
1) Авторизация в платежной системе это вход в свою электронную почту яндекс.
2) Работает через веб-интерфейс, а значит нет привязки к определенной ОС.
3) Интуитивно понятный интерфейс на русском языке.
4) Способов ввод/вывода достаточно, чтоб выбрать для себя подходящий.
5) Обычно не возникают проблемы при использовании платежной системы. И как следствие нет нужды обращаться в тех поддержку.
6) Приемлемый уровень безопасности. Возможность повышение защиты при переходе на получение паролей по СМС.
7) Возможность привязки к банковскому счёту, например Альфа-Банк.
8) Возможна оплата товаров и услуг.
9) Предлагают выпустить пластиковую карту (эмитент Тинькофф банк).
Минусы:
1) Комиссия.
2) Не высокие лимиты снятие. За раз до 15 тысяч. А в месяц до 100, если это базовый вариант кошелька.